Медицинская реабилитация военнослужащих с посттравматическими стрессовыми расстройствами.
Медицинская реабилитация военнослужащих с последствиями минно-взрывных ранений.
Медицинская реабилитация военнослужащих с нарушениями опорно-двигательного аппарата.
Научный потенциал филиала представлен 28 сотрудниками, имеющими ученую степень и звание. В их составе докторов медицинских наук – 10, кандидатов медицинских наук – 18, профессоров и доцентов – 8. В филиале трудятся 13 Заслуженных врачей РФ, 9 Заслуженных работников здравоохранения.
За 2014 год защищены и утверждены Высшей аттестационной комиссией 4 диссертационные работы на соискание ученой степени кандидата медицинских наук; подготовлено и опубликовано 18 научных статей, 12 учебно-методических пособий